La revista Ecología en Bolivia genera dos números por volumen por año. Publica artículos originales y notas en español o inglés con carácter científico y de alta calidad en áreas que incluyen ecosistemas, ecología del paisaje, ecología de poblaciones, ecología de comunidades, ecofisiología, ecología conductual, sistemática, evolución, genética de poblaciones, biogeografía, paleobiología, parasitología, botánica, zoología, biología de la conservación, etnobiología, manejo de vida silvestre, áreas protegidas, agroecología y calidad ambiental. Los trabajos deberán haber sido realizados total o parcialmente en Bolivia, o bien totalmente en otros países, pero cuya temática resulte pertinente a Bolivia (p.e. especies presentes en Bolivia, eco-regiones comunes con Bolivia y/o rangos de distribución de especies compartidas). Los trabajos taxonómicos serán aceptados siempre que incluyan un componente de historia natural (ecológico, evolutivo y/o biogeográfico) asociado a las temáticas enunciadas.